Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX54Q8TDD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DDX54Q8TDD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DDX54Q8TDD1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms