Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MGARPQ8TDB4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MGARPQ8TDB4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MGARPQ8TDB4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms