Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBA3Q8TBC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBA3Q8TBC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms