Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMO3Q8TAP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMO3Q8TAP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMO3Q8TAP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms