Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNL1Q8NG31 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KNL1Q8NG31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms