Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC148Q8NFR7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC148Q8NFR7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC148Q8NFR7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms