Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARID1BQ8NFD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARID1BQ8NFD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID1BQ8NFD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms