Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLHDC9Q8NEP7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHDC9Q8NEP7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms