Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCPH1Q8NEM0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MCPH1Q8NEM0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352.7 ms