Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMGNT2Q8NAT1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POMGNT2Q8NAT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POMGNT2Q8NAT1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms