Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTD1Q8N815 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTD1Q8N815 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms