Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR4Q8IZ21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR4Q8IZ21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR4Q8IZ21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms