Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB5

LIX1L, LIX1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1LQ8IVB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIX1LQ8IVB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIX1LQ8IVB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIX1LQ8IVB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms