Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALYREFQ86V81 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms