Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCGF5Q86SE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCGF5Q86SE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCGF5Q86SE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms