Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RBBP6Q7Z6E9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP6Q7Z6E9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms