Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms