Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARCQ7LC44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARCQ7LC44 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARCQ7LC44 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms