Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
PREX2Q70Z35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PREX2Q70Z35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PREX2Q70Z35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PREX2Q70Z35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms