Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP34Q70CQ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP34Q70CQ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP34Q70CQ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP34Q70CQ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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