Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCIMPQ6UWF3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCIMPQ6UWF3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCIMPQ6UWF3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms