Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUX4L9Q6RFH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DUX4L9Q6RFH8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DUX4L9Q6RFH8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms