Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAF7Q6Q0C0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAF7Q6Q0C0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAF7Q6Q0C0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAF7Q6Q0C0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms