Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHBDF2Q6PJF5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDF2Q6PJF5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms