Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZCCHC12Q6PEW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZCCHC12Q6PEW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZCCHC12Q6PEW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms