Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8BQ6P9F7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC8BQ6P9F7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC8BQ6P9F7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms