Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKN3Q6P5Z2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN3Q6P5Z2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms