Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EFCAB12Q6NXP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EFCAB12Q6NXP0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EFCAB12Q6NXP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms