Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEPROQ6NW34 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEPROQ6NW34 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEPROQ6NW34 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms