Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC8EQ6NSJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms