Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms