Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM42Q69YG0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM42Q69YG0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM42Q69YG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms