Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHEQ5VZ18 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHEQ5VZ18 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHEQ5VZ18 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms