Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HES3Q5TGS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HES3Q5TGS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms