Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSL3PQ5NE16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTSL3PQ5NE16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSL3PQ5NE16 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms