Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFDP3Q5H9I0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFDP3Q5H9I0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFDP3Q5H9I0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms