Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF6Q58WW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF6Q58WW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF6Q58WW2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms