Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZC2HC1CQ53FD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZC2HC1CQ53FD0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZC2HC1CQ53FD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms