Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKDCCQ504Y2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PKDCCQ504Y2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKDCCQ504Y2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKDCCQ504Y2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms