Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA3BQ502W6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA3BQ502W6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms