Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MINDY4Q4G0A6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MINDY4Q4G0A6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms