Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NBPF20Q3BBV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NBPF20Q3BBV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NBPF20Q3BBV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms