Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TWISTNBQ3B726 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TWISTNBQ3B726 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TWISTNBQ3B726 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TWISTNBQ3B726 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms