Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LETM2Q2VYF4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LETM2Q2VYF4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LETM2Q2VYF4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LETM2Q2VYF4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LETM2Q2VYF4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM2Q2VYF4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LETM2Q2VYF4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
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