Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM1Q2NKQ1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSM1Q2NKQ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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