Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC142Q17RM4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC142Q17RM4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC142Q17RM4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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