Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMN1Q16637 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMN1Q16637 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMN1Q16637 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMN1Q16637 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMN1Q16637 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMN1Q16637 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMN1Q16637 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMN1Q16637 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMN1Q16637 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMN1Q16637 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMN1Q16637 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMN1Q16637 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMN1Q16637 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMN1Q16637 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMN1Q16637 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMN1Q16637 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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