Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFE2Q16621 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NFE2Q16621 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFE2Q16621 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms