Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPTX1Q15818 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPTX1Q15818 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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