Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SF1Q15637 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SF1Q15637 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SF1Q15637 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SF1Q15637 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SF1Q15637 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SF1Q15637 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF1Q15637 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SF1Q15637 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF1Q15637 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SF1Q15637 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF1Q15637 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF1Q15637 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF1Q15637 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SF1Q15637 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SF1Q15637 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SF1Q15637 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SF1Q15637 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SF1Q15637 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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